Browsing by Author "Kuşdemir, Gülnur"

Now showing 1 - 2 of 2

Expression and Prognostic Value of Ing3 in Advanced Laryngeal Squamous Cell Carcinoma
(2023) Gündoğdu, Betül; Karatas, Omer; Tatar, Arzu; Şahin, Abdulkadir; Barlak, Neslisah; Kuşdemir, Gülnur; Gümüş, Rasim
Objectives: Laryngeal squamous cell carcinomas (LSCC) is one of the most common aggressive neoplasms of the head and neck region. There is a significant need for identification of successful and accurate prognostic markers to better estimate the clinical outcomes for LSCC patients. In this study, we aimed at analyzing the differential expressions of inhibitor growth (ING) family members and to evaluate the prognostic values of deregulated ING genes in LSCC. Methods: We investigated the relative expressions of ING genes in laryngeal tumor-normal tissue pairs in the mRNA level using quantitative real-time polymerase chain reaction and relative expression of ING3 in the protein level using Western Blot analysis. Results: The rate of genetic alterations of ING3 was relatively higher in head and neck cancer including LSCC. ING3 expression was significantly upregulated in LSCC tissue samples in both mRNA and protein level. Higher expression of ING3 was also correlated with poor disease-free survival of patients with head and neck cancer. Conclusions: Our findings assigned an oncogenic feature for ING3 in laryngeal cancer with a significant upregulation detected in advanced cases and suggested a vital prognostic potential for ING3.
ING3 Geninin Baş Boyun Kanserlerinde Fonksiyonunun Araştırılması
(2022) Kuşdemir, Gülnur; Karataş, Ömer Faruk
Agresif bir kanser türü olan baş ve boyun kanserleri dünya genelinde en sık tanısı konan kanserler arasındadır. Dünya genelinde baş ve boyun kanserleri 5 yıllık sağkalım oranları %60'lar civarında olmasına rağmen, ülkemizde bu oran dünya ortalamasının oldukça altındadır. Inhibitor of growth protein (ING) ailesi 5 üyeden oluşmaktadır (ING1-5). ING proteinleri çok sayıda hücresel süreçte önemli roller oynamaktadır. Bu nedenle ING genlerinin ifade değişiklikleri tümör oluşumu ile ilişkilendirilebilir. Bu tezde, ING ailesi üyelerinin ifadelerinin analizi ve baş ve boyun kanserlerinden olan larenks kanserinde ING genlerinin prognostik öneminin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Bu doğrultuda, larenks tümör ve normal doku çiftlerinde rölatif ING gen ailesi ifadesi mRNA seviyesinde gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu kullanılarak, rölatif ING3 ifadesi protein seviyesinde Western blot analizi kullanılarak değerlendirildi. ING genlerinin ifade seviyeleri, genetik değişiklikleri ve sağkalım verileri online veritabanları kullanılarak araştırıldı ve ING3'ün protein etkileşim ağı STRING web portalı kullanılarak ortaya koyuldu. Baş ve boyun kanserlerinde ING3'ün genetik değişiklik oranının oldukça yüksek olduğu gösterildi. ING3'ün hem mRNA hem de protein seviyesinde larenks kanseri doku örneklerinde normal doku örneklerine kıyasla artan ifadeye sahip olduğu doğrulandı. Yüksek ING3 ifadesinin, baş ve boyun kanseri hastalarının hastalıksız sağ kalımı ile ilişkili olduğu gösterildi. Ayrıca, birlikte ifade analizi, EPC1'in önemli ölçüde ING3 ile ilişkili kritik bir gen olduğunu ortaya koydu. Tez kapsamında elde edilen bulgular, ileri evre larenks kanseri vakalarında ING3'ün yüksek düzeyde ifade edildiği ve onkogenik potansiyel sergileyerek larenks kanser gelişim sürecine önemli derecede katkıda bulunduğunu gösterdi. ING3'ün ileri evre larenks kanser hastaları için hayati prognostik önemi, biyobelirteç olarak kullanılabilme potansiyelini ortaya koymaktadır.