Sığır Listeriosis atık Vakalarının Bulunduğu İşletme Ortamlarından Tespit Edilen Listeria monocytogenes’in Genotipik Çeşitliliğinin Araştırılması

Abstract

Sığır tüberkülozu dünyanın birçok yerinde endemik olan, hayvancılıktan elde edilen verimi olumsuz yönde etkileyen ve küresel bir halk sağlığı tehdidi oluşturan sığırların bulaşıcı zoonotik bir hastalığıdır. Ülkemizde sığır tüberkülozuyla mücadele kapsamında karantina, kesim ve imha tedbirleri uygulanmaktadır. Enfeksiyon subklinik bir seyir izlediğinden klinik muayene ile teşhis edilemez ve bu durum hastalıkla mücadeleyi büyük ölçüde güçleştirmektedir. Mycobacterium bovis Mycobacterium genusu içerisinde Mycobacterium tuberculosis complex içinde yer alır. Mycobacterium genusu içinde 150’den fazla tanımlanmış Mycobacterium alt tipi bulunmaktadır. Bu projede, Erzurum Veteriner Kontrol Enstitüsü görev alanı içerisindeki 9 ilden (Ağrı, Ardahan, Artvin, Bayburt, Erzincan, Erzurum, Gümüşhane, Iğdır, Kars) toplam 207 tüberküloz şüpheli numune alınacaktır. Alınan örnekler ilk önce histopatolojik ve Real-time PCR yöntemleri ile incelenecektir. Real-time PCR yöntemi ile Mycobacterium bovis tespit edilen numunelerden MIRU-VNTR yöntemi ile genotiplendirme yapılarak bölgeye özgü baskın suşlar belirlenecek ve baskın olan 4 suştan shotgun dizileme yapılacaktır. İmmunohistokimyasal boyama yöntemiyle immun yanıt düzeylerine göre yüksek patojen suşlar belirlenecek ve moleküler epidemiyolojik bir profil çıkarılacaktır. Çalışma sonucunda yapılan genotipleme ile enfeksiyon kaynakları, çiftlik hayvanları ve vahşi yaşam veya insanlar arasındaki bulaşma yollarının yaygınlığı tespit edilerek hastalığın kontrol ve eradikasyon programlarına katkı sağlanacaktır. Ayrıca belirlenen suşlara bağlı immun yanıtın nasıl olduğu bilgisi elde edilerek hastalığa ilişkin teşhis testleri ve aşılar gibi temel hastalık eradikasyonu araçlarının gelişimi için de yön gösterecektir.

Bovine tuberculosis is a contagious zoonotic disease of cattle that is endemic in many parts of the world, adversely affects livestock productivity and poses a global public health threat. In our country, quarantine, slaughter and destruction measures are implemented within the scope of combating bovine tuberculosis Since the infection follows a subclinical course, it cannot be diagnosed by clinical examination and this makes the fight against the disease greatly difficult. Mycobacterium bovis is located in the Mycobacterium tuberculosis complex within the Mycobacterium genus. There are more than 150 defined Mycobacterium subtypes within the Mycobacterium genus. In this project, a total of 207 tuberculosis suspected samples will be taken from 9 provinces (Ağrı, Ardahan, Artvin, Bayburt, Erzincan, Erzurum, Gümüşhane, Iğdır, Kars) within the scope of the Erzurum Veterinary Control Institute. The samples taken will first be examined by histopathological and Real-time PCR methods. Genotyping with MIRU-VNTR method will be performed from the samples detected Mycobacterium bovis by real-time PCR method and the dominant strains specific to the region will be determined and shotgun sequencing will be performed from the 4 dominant strains. By immunohistochemical staining method, high pathogenic strains will be determined according to their immune response levels and a molecular epidemiological profile will be drawn.As a result of the study, genotyping will contribute to the control and eradication programs of the disease by determining the sources of infection, the prevalence of transmission routes between farm animals and wildlife or people. In addition, information about the immune response of the determined strains will be obtained and it will guide the development of basic disease eradication tools such as diagnostic tests and vaccines.