Sorgum [Sorghum Bicolor (L.) Moench] Genomunda Bes1 Transkripsiyon Faktör Ailesinin Genom Çaplı Analizi

Abstract

BES1 transkripsiyon faktörü ailesi brassinosteroidlerin biyosentezinde önemli bir role sahiptir. Bitki büyüme ve gelişmesüreçlerini ve çevresel streslere yanıt mekanizmasını etkileyen bir steroid hormonudur. Bu çalışmanın amacı sorgum[Sorghum bicolor (L.) Moench] bitkisinin farklı dokularında farklı azot kaynakları (kontrol gübresi, amonyak, nitrat, üre)uygulanarak bu dokulardaki BES1 transkripsiyon faktörünün ifade profillerini belirlemek ve in siliko olarak BES1 genailesinin üyelerini genom çapında tespit ederek karakterize etmektir. Sorgum genomunda amino asit sayıları 190 ile 716,moleküler ağırlıkları 35.27 ile 80.54 kDa ve izoelektrik noktaları 5.0 ile 10.07 arasında değişen 9 Sobic-BES1 proteinibelirlenmiştir. Gen yapısı analizlerinde tahmini ekzonların sayısı 2 ile 10 arasında değişmiştir. S. bicolor, Arabidopsisthaliana ve Oryza sativa türlerinin BES1 proteinleri kullanılarak filogenetik ilişki tespit edilmiştir. Evrimsel süreçte SobicBES1 -4 ve Sobic-BES1-9 genlerinin segmental duplike olduğu belirlenmiştir. İn siliko gen ifade analizlerine göre farklı azotkaynaklarının ve su kontrolünün uygulandığı kök ve sürgün dokularında Sobic-BES1 -4 ve -9 genlerinin ifade seviyelerininen yüksek olduğu, diğer taraftan kullanılan azot kaynağına ve dokuya göre Sobic-BES1 -1, Sobic-BES1 -2 ve Sobic-BES1 -8genlerinin ifade seviyelerinin farklılık gösterdiği belirlenmiştir. Bu çalışmanın sonuçları fonksiyonel gen araştırmaları içinbir temel sağlayacak olup, sorgum bitkisinde BES1 gen ailesinin anlaşılmasına katkı sunacaktır.